Tijdens de tweede fase wisselt u  elektronisch gegevens uit met PGNPO. Deze uitwisseling is bedoeld om de kwaliteit van de data in uw leerlingenadministratiesysteem, waar nodig, te verbeteren. De aangeleverde burgerservicenummers worden gecontroleerd en indien nodig worden er onderwijsnummers toegekend. Deze controle vooraf voorkomt dat er onnodige problemen ontstaan in het vervolgtraject, de fase aansluiting BRON. 

Na het uitvoeren van de PGN-scan 2 ontvangt u van PGNPO een rapport met daarin een overzicht van de gegevens die nog fouten en/of onvolledigheden bevatten. Op basis van deze rapportage kunt u de gegevens herstellen of aanvullen. Tijdens deze fase kunt u gegevens meerdere malen bij PGNPO ter controle aanbieden.